معرفی شرکت ها

تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

توضیحات

ویژگی	مقدار
سیستم عامل	-
نام فایل	FastaIndex-0.11rc7
نام	FastaIndex
نسخه کتابخانه	0.11rc7
نگهدارنده	[]
ایمیل نگهدارنده	[]
نویسنده	Leszek Pryszcz
ایمیل نویسنده	l.p.pryszcz+distutils@gmail.com
آدرس صفحه اصلی	https://github.com/lpryszcz/FastaIndex
آدرس اینترنتی	https://pypi.org/project/FastaIndex/
مجوز	GPLv2

FastaIndex ========== FastA index (.fai) handler compatible with `samtools faidx <http://www.htslib.org/doc/faidx.html>`_. .fai is extended with 4 columns storing counts for A, C, G & T for each sequence. Usage ----- Dependencies ~~~~~~~~~~~~ - Python 2.7 Parameters ~~~~~~~~~~ -h, --help show this help message and exit --version show program's version number and exit -v, --verbose verbose -i FASTA, --fasta FASTA FASTA file(s) -o OUT, --out OUT output stream [stdout] -r REGIONS, --regions REGIONS contig(s) or contig region(s) to output (returns reverse complement if end larger than start) -N N calculate NXX and exit ie N50 -L L calculate LXX and exit ie L50 -S, --stats return FastA stats aka fasta_stats Examples ~~~~~~~~ .. code-block:: bash # retrieve sequence of scaffold00001 starting at 100 and ending at 200 base (0-based) FastaIndex -i contigs.fa -r 'scaffold00001:100-200' # retrieve reverse complement of the same region FastaIndex -i contigs.fa -r 'scaffold00001:200-100' # calculate N50 of FastA file FastaIndex -i contigs.fa -N50 # more statistics of FastA file FastaIndex -i contigs.fa -S # or fasta_stats -i contigs.fa Installation ------------ .. code-block:: bash sudo pip install -U FastaIndex

نحوه نصب

نصب پکیج whl FastaIndex-0.11rc7:

pip install FastaIndex-0.11rc7.whl

نصب پکیج tar.gz FastaIndex-0.11rc7:

pip install FastaIndex-0.11rc7.tar.gz