معرفی شرکت ها

تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

توضیحات

Energy Evaluation of Single Mutant Homology Models

ویژگی	مقدار
سیستم عامل	-
نام فایل	EESMHM-1.9
نام	EESMHM
نسخه کتابخانه	1.9
نگهدارنده	[]
ایمیل نگهدارنده	[]
نویسنده	Evan Edelstein
ایمیل نویسنده	edelsteinevan@gmail.com
آدرس صفحه اصلی	https://github.com/eved1018/EESMHM
آدرس اینترنتی	https://pypi.org/project/EESMHM/
مجوز	MIT

### Energy Evaluation of Single Mutant Homology Models: ### Installation and Dependencies: 1. Install: ```sh pip install EESMHM ``` 2. Download Modeller: https://salilab.org/modeller/download_installation.html * for Conda enviroment: ```sh conda config --add channels salilab conda install modeller ``` 3. Download EvoEF (https://github.com/tommyhuangthu/EvoEF). 4. Download Foldx (https://foldxsuite.crg.eu/). ### Configuration File: The config.txt is used to guide the mutagensis and is organzied in two parts part 1: paths ```sh #foldx {foldx path} #evoef {evoef path} ``` part 2: mutation config: `1 letter amino acid code` `residue number` `comma seprated list of amino acids to mutate to or * for all` If left empty all interface positions will be mutated. ### Command line Arguments: * `-pdb`: RCSB PDB id, if not provided you will be prompted to select one. If it is is in the current working directory it will be used. Otherwise it will be downloaded from the RCSB. * `-qc`: Query chain to mutate. * `-ic`: Partner chain. * `-config`: config file path * `-foldx`: foldx path * `-evoef`: Evoef path

نحوه نصب

نصب پکیج whl EESMHM-1.9:

pip install EESMHM-1.9.whl

نصب پکیج tar.gz EESMHM-1.9:

pip install EESMHM-1.9.tar.gz