معرفی شرکت ها

تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

توضیحات

Tracking cells and lineage with deep learning.

ویژگی	مقدار
سیستم عامل	-
نام فایل	DeepCell-Tracking-0.6.4
نام	DeepCell-Tracking
نسخه کتابخانه	0.6.4
نگهدارنده	[]
ایمیل نگهدارنده	[]
نویسنده	Van Valen Lab
ایمیل نویسنده	vanvalenlab@gmail.com
آدرس صفحه اصلی	https://github.com/vanvalenlab/deepcell-tracking
آدرس اینترنتی	https://pypi.org/project/DeepCell-Tracking/
مجوز	LICENSE

# ![DeepCell Tracking Banner](https://raw.githubusercontent.com/vanvalenlab/deepcell-tracking/master/docs/images/DeepCell_tracking_Banner.png) [![PyPI version](https://badge.fury.io/py/DeepCell-Tracking.svg)](https://badge.fury.io/py/DeepCell-Tracking) [![Build Status](https://github.com/vanvalenlab/deepcell-tracking/workflows/build/badge.svg)](https://github.com/vanvalenlab/deepcell-tracking/actions) [![Coverage Status](https://coveralls.io/repos/github/vanvalenlab/deepcell-tracking/badge.svg?branch=master)](https://coveralls.io/github/vanvalenlab/deepcell-tracking?branch=master) `deepcell-tracking` uses deep learning models from [deepcell-tf](https://github.com/vanvalenlab/deepcell-tf) within an assignment problem framework to [track cells through time-lapse sequences](https://www.biorxiv.org/content/10.1101/803205v2) and build cell lineages. The assignment problem is solved using the [Hungarian algorithm.](https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC2747604/) ## Getting Started `deepcell-tracking` is a Python package that can be installed with `pip`: ```bash pip install deepcell-tracking ``` Or it can be installed from source: ```bash git clone https://github.com/vanvalenlab/deepcell-tracking.git cd deepcell-tracking # install the dependencies pip install . ``` ## How to Use ```python from deepcell_tracking import CellTracker # X and y are the time-sequence data and their corresponding segmentations (labels), respectively. # model is a deepcell-tf tracking model. tracker = CellTracker(X, y, model) tracker.track_cells() # runs in place, builds tracks # Save all tracked data and lineage files to a .trk file tracker.dump('./results.trk') # Open the track file from deepcell_tracking.utils import load_trks data = load_trks('./results.trk') lineage = data['lineages'] # linage information X = data['X'] # raw X data y = data['y'] # tracked y data ```

نحوه نصب

نصب پکیج whl DeepCell-Tracking-0.6.4:

pip install DeepCell-Tracking-0.6.4.whl

نصب پکیج tar.gz DeepCell-Tracking-0.6.4:

pip install DeepCell-Tracking-0.6.4.tar.gz