معرفی شرکت ها

DSSPparser-0.1.3

Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
0.1.3
0.1.3

توضیحات

parse protein secondary structure; dssp file; DSSP api interface; transform PDB format to dssp format
ویژگی مقدار
سیستم عامل -
نام فایل DSSPparser-0.1.3
نام DSSPparser
نسخه کتابخانه 0.1.3
نگهدارنده ['wanglei']
ایمیل نگهدارنده []
نویسنده wanglei
ایمیل نویسنده wanglei94@hust.edu.cn
آدرس صفحه اصلی https://github.com/wangleiofficial/DSSPparser
آدرس اینترنتی https://pypi.org/project/DSSPparser/
مجوز MIT
# DSSPparser [![PyPI - Version](https://img.shields.io/pypi/v/DSSPparser.svg?style=flat)](https://pypi.org/project/DSSPparser/) [![PyPI - Python Version](https://img.shields.io/pypi/pyversions/DSSPparser.svg)](https://pypi.org/project/DSSPparser/) [![GitHub - LICENSE](https://img.shields.io/github/license/neolei/DSSPparser.svg?style=flat)](./LICENSE.txt) [![Build Status](https://travis-ci.org/neolei/DSSPparser.svg?branch=master)](https://travis-ci.org/neolei/DSSPparser) [![codecov](https://codecov.io/gh/neolei/DSSPparser/branch/master/graph/badge.svg)](https://codecov.io/gh/neolei/DSSPparser) DSSPparser is an easy tool to parse dssp file, and can transform PDB format file to dssp format file by [dssp](https://anaconda.org/salilab/dssp),also support the tansfrom between the PDB id and dssp format, hssp format and sequence. ## Install stabel verison ``` pip install DSSPparser ``` lastest version ``` pip install git+https://github.com/neolei/DSSPparser.git ``` ## Examples parse dssp file to pandas.dataframe ``` from DSSPparser import parseDSSP parser = parseDSSP('2GW9.dssp') parser.parse() pddict = parser.dictTodataframe() ``` Transform between the PDB format and dssp format - Note: please install the DSSP software. ``` conda install -c salilab dssp ``` ``` from DSSPparser import pdbToxssp_local result = pdbToxssp("2GW9") ``` ## License Released under the MIT license.


نیازمندی

مقدار نام
- pandas
- requests
- biopython


نحوه نصب


نصب پکیج whl DSSPparser-0.1.3:

    pip install DSSPparser-0.1.3.whl


نصب پکیج tar.gz DSSPparser-0.1.3:

    pip install DSSPparser-0.1.3.tar.gz