معرفی شرکت ها

تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

توضیحات

DNBC4 scRNA QC

ویژگی	مقدار
سیستم عامل	-
نام فایل	DNBC4-test-1.0.7
نام	DNBC4-test
نسخه کتابخانه	1.0.7
نگهدارنده	[]
ایمیل نگهدارنده	[]
نویسنده	lishuangshuang3
ایمیل نویسنده	lishuangshuang3@mgi-tech.com
آدرس صفحه اصلی	https://github.com/MGI-tech-bioinformatics/DNBelab_C_Series_HT_scRNA-analysis-software
آدرس اینترنتی	https://pypi.org/project/DNBC4-test/
مجوز	MIT

# DNBC4tools An open source and flexible pipeline to analysis high-throughput DNBelab C Series single-cell RNA datasets ## Introduction - **Propose** - An open source and flexible pipeline to analyze DNBelab C Series<sup>TM</sup> single-cell RNA datasets. - **Language** - Python3 and R scripts. - **Hardware/Software requirements** - x86-64 compatible processors. - require at least 50GB of RAM and 4 CPU. - centos 7.x 64-bit operating system (Linux kernel 3.10.0, compatible with higher software and hardware configuration). ## Installation installation manual ### Install miniconda and creat DNBC4tools environment - Git clone ``` git clone https://github.com/lishuangshuang0616/DNBC4tools.git ``` - Install miniconda3 ``` wget -nv https://repo.anaconda.com/miniconda/Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh sh Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh -b -p $PATH ``` - Creat DNBC4tools environment ``` cd DNBC4tools source /miniconda3/bin/activate conda env create -f DNBC4tools_conda.yaml -n DNBC4tools ``` - Install R package that cannot be installed using conda ``` conda activate DNBC4tools Rscript -e "devtools::install_github(c('chris-mcginnis-ucsf/DoubletFinder','ggjlab/scHCL','ggjlab/scMCA'),force = TRUE);" ```

نیازمندی

مقدار	نام
==4.14.3	plotly
==3.5.1	matplotlib
==0.70.12.2	multiprocess
==0.8.0	plotnine
==0.13.10	polars
==0.18.0	pysam
==1.8.0	scipy
==0.13.2	statsmodels
==0.11.1	datatable
==1.22.2	numpy
==1.4.1	pandas

زبان مورد نیاز

مقدار	نام
>=3.7.*	Python

نحوه نصب

نصب پکیج whl DNBC4-test-1.0.7:

pip install DNBC4-test-1.0.7.whl

نصب پکیج tar.gz DNBC4-test-1.0.7:

pip install DNBC4-test-1.0.7.tar.gz