معرفی شرکت ها

DGet-0.7

Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
0.7
0.6
0.5
0.4
0.3
0.2
0.7
0.6
0.5
0.4
0.3
0.2

توضیحات

Calculates compound deuteration from ToF-MS data.
ویژگی مقدار
سیستم عامل -
نام فایل DGet-0.7
نام DGet
نسخه کتابخانه 0.7
نگهدارنده []
ایمیل نگهدارنده []
نویسنده djdt
ایمیل نویسنده -
آدرس صفحه اصلی https://github.com/djdt/dget
آدرس اینترنتی https://pypi.org/project/DGet/
مجوز GPL3
Usage ===== DGet is a command line tool for calculating molecule deuteration. To see a full list of CLI options, run the help:: $ dget --help Basic Usage ----------- To use DGet pass a molecular formula, mass spectra text file and optionally the adduct formed:: $ dget C12HD8N <path-to-ms-file.csv> --adduct "[M-H]-" This will print the deuteration of the base molecule ``%Deuteration`` and the predicted deuteration of every possible deuteration state from ``D0`` (no deuterium) to ``Dn`` (full deuterium):: Formula : C12H[2H]8N Adduct : [M-H]- M/Z : 175.1237 Adduct M/Z : 174.1164 %Deuteration : 93.66 % Deuteration Ratio Spectra D0 : 0.15 % D1 : 0.18 % D2 : 0.20 % D3 : 0.26 % D4 : 0.39 % D5 : 1.41 % D6 : 6.05 % D7 : 27.79 % D8 : 63.56 % Plotting -------- To visualise the deuteration and mass spectrum pass ``--plot``:: $ dget C12HD8N <path-to-ms-file.csv> --adduct "[M-H]-" --plot This will show the deconvloved deuteration spectra in red and the predicted adduct spectra in blue. These spectra are scaled to fit the mass data so absolute heights will not be indicative of good fit. .. image:: https://github.com/djdt/djdt.github.io/raw/main/img/dget_c12hd8n.png Plotting depends on `matplotlib <https://matplotlib.org>`_. Web App ------- A web application of DGet is avaliable at `<https://djdt.github.io/dget>`_. Details on its usage can be found on the `Help <https://djdt.github.io/dget/help>`_ page. Installation ============ DGet is available on PyPI and can be installed via ``pip``:: $ pip install dget To install DGet from source first clone the repository:: $ git clone https://github.com/djdt/dget Then install using ``pip``:: $ cd dget $ pip install . Requirements ------------ * `numpy >= 1.22 <https://numpy.org>`_ * `molmass <https://github.com/cgohlke/molmass>`_ * `matplotlib <https://matplotlib.org>`_ (optional, for plotting) Documentation ============= Documentation is avaliable at `<https://dget.readthedocs.io>`_.


نیازمندی

مقدار نام
>=1.22 numpy
- molmass
- pytest


نحوه نصب


نصب پکیج whl DGet-0.7:

    pip install DGet-0.7.whl


نصب پکیج tar.gz DGet-0.7:

    pip install DGet-0.7.tar.gz