معرفی شرکت ها

تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

توضیحات

Hierarchical non-parametric Bayesian clustering of digital expression data

ویژگی	مقدار
سیستم عامل	-
نام فایل	DGEclust-17.10.16
نام	DGEclust
نسخه کتابخانه	17.10.16
نگهدارنده	[]
ایمیل نگهدارنده	[]
نویسنده	Dimitrios V. Vavoulis
ایمیل نویسنده	dimitris.vavoulis@well.ox.ac.uk
آدرس صفحه اصلی	http://dvav.me/dgeclust/
آدرس اینترنتی	https://pypi.org/project/DGEclust/
مجوز	MIT

**DGEclust** is a program for clustering and differential expression analysis of digital expression data generated by next-generation sequencing assays, such as RNA-seq, CAGE and others. It takes as input a table of count data and it estimates the number and parameters of the clusters supported by the data. At a later stage, these can be used for identifying differentially expressed genes and for gene- and sample-wise clustering of the original data matrix. Internally, **DGEclust** uses a *Hierarchical Dirichlet Process Mixture Model* for modeling over-dispersed count data, combined with a *blocked Gibbs sampler* for efficient Bayesian learning. This program is part of the software collection of the [Computational Genomics Group](http://bioinformatics.bris.ac.uk/) at the University of Bristol and it is under continuous development. You can find more technical details on the statistical methodologies used in this software in the following papers: 1. http://www.genomebiology.com/2015/16/1/39 (Vavoulis et al., *Genome Biology* 16:39, **2015**) 2. http://arxiv.org/abs/1301.4144 (Vavoulis & Gough, *J Comput Sci Syst Biol* 7:001-009, **2013**) For more information, including bug reports, send an email to <Dimitris.Vavoulis@ndcls.ox.ac.uk> or <Julian.Gough@bristol.ac.uk> Enjoy!

نحوه نصب

نصب پکیج whl DGEclust-17.10.16:

pip install DGEclust-17.10.16.whl

نصب پکیج tar.gz DGEclust-17.10.16:

pip install DGEclust-17.10.16.tar.gz