معرفی شرکت ها


DGEclust-17.10.16


Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

توضیحات

Hierarchical non-parametric Bayesian clustering of digital expression data
ویژگی مقدار
سیستم عامل -
نام فایل DGEclust-17.10.16
نام DGEclust
نسخه کتابخانه 17.10.16
نگهدارنده []
ایمیل نگهدارنده []
نویسنده Dimitrios V. Vavoulis
ایمیل نویسنده dimitris.vavoulis@well.ox.ac.uk
آدرس صفحه اصلی http://dvav.me/dgeclust/
آدرس اینترنتی https://pypi.org/project/DGEclust/
مجوز MIT
**DGEclust** is a program for clustering and differential expression analysis of digital expression data generated by next-generation sequencing assays, such as RNA-seq, CAGE and others. It takes as input a table of count data and it estimates the number and parameters of the clusters supported by the data. At a later stage, these can be used for identifying differentially expressed genes and for gene- and sample-wise clustering of the original data matrix. Internally, **DGEclust** uses a *Hierarchical Dirichlet Process Mixture Model* for modeling over-dispersed count data, combined with a *blocked Gibbs sampler* for efficient Bayesian learning. This program is part of the software collection of the [Computational Genomics Group](http://bioinformatics.bris.ac.uk/) at the University of Bristol and it is under continuous development. You can find more technical details on the statistical methodologies used in this software in the following papers: 1. http://www.genomebiology.com/2015/16/1/39 (Vavoulis et al., *Genome Biology* 16:39, **2015**) 2. http://arxiv.org/abs/1301.4144 (Vavoulis & Gough, *J Comput Sci Syst Biol* 7:001-009, **2013**) For more information, including bug reports, send an email to <Dimitris.Vavoulis@ndcls.ox.ac.uk> or <Julian.Gough@bristol.ac.uk> Enjoy!


نحوه نصب


نصب پکیج whl DGEclust-17.10.16:

    pip install DGEclust-17.10.16.whl


نصب پکیج tar.gz DGEclust-17.10.16:

    pip install DGEclust-17.10.16.tar.gz