معرفی شرکت ها

DEERPREdict-0.2.0

Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

توضیحات

A package for DEER and PRE predictions based on molecular dynamics ensembles. Can be installed with pip.
ویژگی مقدار
سیستم عامل -
نام فایل DEERPREdict-0.2.0
نام DEERPREdict
نسخه کتابخانه 0.2.0
نگهدارنده []
ایمیل نگهدارنده []
نویسنده João M Martins, Micha BA Kunze, Ramon Crehuet and Giulio Tesei
ایمیل نویسنده giulio.tesei@bio.ku.dk
آدرس صفحه اصلی https://github.com/KULL-Centre/DEERpredict
آدرس اینترنتی https://pypi.org/project/DEERPREdict/
مجوز GPLv3
[![Build Status](https://app.travis-ci.com/KULL-Centre/DEERpredict.svg?branch=main)](https://app.travis-ci.com/KULL-Centre/DEERpredict) [![Documentation Status](https://readthedocs.org/projects/deerpredict/badge/?version=latest)](https://deerpredict.readthedocs.io) [![DOI](https://zenodo.org/badge/217526987.svg)](https://zenodo.org/badge/latestdoi/217526987) [![SWH](https://archive.softwareheritage.org/badge/origin/https://github.com/KULL-Centre/DEERpredict/)](https://archive.softwareheritage.org/browse/origin/?origin_url=https://github.com/KULL-Centre/DEERpredict) DEER-PREdict =========== Overview -------- A package for double electron-electron resonance (DEER) and paramagnetic relaxation enhancement (PRE) predictions from molecular dynamics ensembles. Installation ------------ To install DEER-PREdict, use the [PyPI package](https://pypi.org/project/DEERPREdict): ```bash pip install DEERPREdict ``` or clone the repo: ```bash git clone https://github.com/KULL-Centre/DEERpredict.git cd DEERpredict pip install -e . ``` The software requires Python 3.6+. Documentation ------------- [![Documentation Status](https://readthedocs.org/projects/deerpredict/badge/?version=latest&style=for-the-badge)](https://deerpredict.readthedocs.io) Testing ------- Run all the tests in one go ```bash cd DEERpredict python -m pytest ``` or run single tests, e.g. ```bash cd DEERpredict python -m pytest tests/test_PRE.py::test_ACBP python -m pytest tests/test_DEER.py::test_T4L ``` Authors ------------- [Giulio Tesei (@gitesei)](https://github.com/gitesei) [João M Martins (@joaommartins)](https://github.com/joaommartins) [Micha BA Kunze (@mbakunze)](https://github.com/mbakunze) [Ramon Crehuet (@rcrehuet)](https://github.com/rcrehuet) [Kresten Lindorff-Larsen (@lindorff-larsen)](https://github.com/lindorff-larsen) Article ------------- Tesei G, Martins JM, Kunze MBA, Wang Y, Crehuet R, et al. (2021) DEER-PREdict: Software for efficient calculation of spin-labeling EPR and NMR data from conformational ensembles. PLOS Computational Biology 17(1): e1008551. [https://doi.org/10.1371/journal.pcbi.1008551](https://doi.org/10.1371/journal.pcbi.1008551)


نیازمندی

مقدار نام
- Cython
==1.1.1 MDAnalysis
- numpy
- pandas
- matplotlib
- scipy
- h5py
- pyyaml
- sphinx
- recommonmark
- sphinx-rtd-theme
- sphinx-math-dollar
- sphinx-markdown-tables


نحوه نصب


نصب پکیج whl DEERPREdict-0.2.0:

    pip install DEERPREdict-0.2.0.whl


نصب پکیج tar.gz DEERPREdict-0.2.0:

    pip install DEERPREdict-0.2.0.tar.gz