معرفی شرکت ها

Corekaburra-0.0.5

Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
0.0.5
0.0.4
0.0.3
0.0.2
0.0.1
0.0.5
0.0.4
0.0.3
0.0.2
0.0.1

توضیحات

A commandline bioinformatics tool to utilize syntenic information from genomes in the context of pan-genomes
ویژگی مقدار
سیستم عامل -
نام فایل Corekaburra-0.0.5
نام Corekaburra
نسخه کتابخانه 0.0.5
نگهدارنده []
ایمیل نگهدارنده []
نویسنده Magnus Ganer Jespersen
ایمیل نویسنده magnus.ganer.j@gmail.com
آدرس صفحه اصلی https://github.com/milnus/Corekaburra
آدرس اینترنتی https://pypi.org/project/Corekaburra/
مجوز LICENSE
Corekaburra looks at the gene synteny across genomes used to build a pan-genome. Using syntenic information Corekaburra identifies regions between core gene clusters. Regions are described in terms of their content of accessory gene clusters and distance between core genes. Information from neighboring core genes is further used to identify stretches of core gene clusters throughout the pan-genome that appear in all genomes given as input. Corekaburra is compatible with outputs from standard pan-genome pipelines: Roary and Panaroo.


نیازمندی

مقدار نام
==1.79 biopython
>=2.6.3 networkx
>=0.10.1 gffutils
>=1.23.4 numpy


نحوه نصب


نصب پکیج whl Corekaburra-0.0.5:

    pip install Corekaburra-0.0.5.whl


نصب پکیج tar.gz Corekaburra-0.0.5:

    pip install Corekaburra-0.0.5.tar.gz