معرفی شرکت ها

CodonU-1.0.4

Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
1.0.4
1.0.3
1.0.2
0.0.1
1.0.4
1.0.3
1.0.2
0.0.1

توضیحات

This package is designed for helping in genomic analysis
ویژگی مقدار
سیستم عامل -
نام فایل CodonU-1.0.4
نام CodonU
نسخه کتابخانه 1.0.4
نگهدارنده []
ایمیل نگهدارنده []
نویسنده Souradipto Choudhuri
ایمیل نویسنده sourochaudhuri@gmail.com
آدرس صفحه اصلی https://github.com/SouradiptoC/codon_usage
آدرس اینترنتی https://pypi.org/project/CodonU/
مجوز MIT License
[//]: # (# CodonU) [![PyPI - License](https://img.shields.io/pypi/l/CodonU)](https://opensource.org/licenses/MIT) [![Downloads](https://static.pepy.tech/personalized-badge/codonu?period=total&units=international_system&left_color=grey&right_color=blue&left_text=Downloads)](https://pepy.tech/project/codonu) [![CodeFactor](https://www.codefactor.io/repository/github/souradiptoc/codonu/badge/master)](https://www.codefactor.io/repository/github/souradiptoc/codonu/overview/master) [![Docs](https://img.shields.io/badge/docs-passing-brightgreen)](https://souradiptoc.github.io/CodonU/) # Introduction Welcome to CodonU! This is an integrated package for codon usage analysis. # Functionalities Various functionalities can be found below. For gene/genome analysis, this package can: - For Nucleotide sequences - Calculate RSCU - Calculate CAI - Calculate CBI - Calculate ENc - For Protein sequences - Calculate Aromaticity - Calculate gravy One can also can calculate the multivariate analysis, popularly known as correspondence analysis (COA) for the codons easily. Supported calculations are: - For Nucleotide sequences - COA using codon frequency with scale set to length of gene - COA using codon RSCU values with scale set to length of gene - For Protein sequences - COA using amino acid frequency with scale set to gravy score - COA using amino acid frequency with scale set to aromaticity score Phylogenetic analysis and tree building now can be done. Detailed instructions on how to use the functions can be found in the [examples](https://github.com/SouradiptoC/CodonU/tree/master/Examples) # Installation pip install CodonU # Future Plans None. If you would like recommend one, please mail at [sourochaudhuri@gmail.com](mailto:sourochaudhuri@gmail.com)


نحوه نصب


نصب پکیج whl CodonU-1.0.4:

    pip install CodonU-1.0.4.whl


نصب پکیج tar.gz CodonU-1.0.4:

    pip install CodonU-1.0.4.tar.gz