معرفی شرکت ها

CardioWave-0.2.3

Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
0.2.3
0.2.2
0.2.1
0.1.1
0.1.0
0.2.3
0.2.2
0.2.1
0.1.1
0.1.0

توضیحات

A tool to derive parameters from waveform data for cardiotoxicity research
ویژگی مقدار
سیستم عامل -
نام فایل CardioWave-0.2.3
نام CardioWave
نسخه کتابخانه 0.2.3
نگهدارنده []
ایمیل نگهدارنده []
نویسنده Hongbin Yang
ایمیل نویسنده yanyanghong@163.com
آدرس صفحه اصلی https://github.com/zealseeker/cardiowave
آدرس اینترنتی https://pypi.org/project/CardioWave/
مجوز -
# CardioWave: A tool for waveform analysis ![](https://img.shields.io/pypi/v/CardioWave) ![](https://img.shields.io/github/workflow/status/zealseeker/cardiowave/Python%20Package%20using%20Conda) ![](https://img.shields.io/codacy/grade/2a5804469cc44f2f8643f28bd3ca9bfa) ![](https://img.shields.io/codacy/coverage/2a5804469cc44f2f8643f28bd3ca9bfa) [![Documentation Status](https://readthedocs.org/projects/cardiowave/badge/?version=latest)](https://cardiowave.readthedocs.io/en/latest/?badge=latest) ## Parameters we can calculate Common waveform parameters include peak count, average peak amplitude, etc. For more details please check [Supporting Parameters](docs/support_parameters.rst) ## Usage Prepare a CSV table like this format: compound|concentration|well|plate|..others..|time|signal ----|----|----|-----|----|----|---- CP1|0.1|A1|P1|...|0|1000 CP1|0.1|A1|P1|...|0.33|1001 ...|...|...|...|...|...|... CP2|0.1|A2|P1|...|0|1000 ...|...|...|...|...|...|... The order of the rows and columns do not need to be fixed but the column names must be exactly the same to the required (e.g. lowercase). The following columns are compursory: 'plate', 'compound', 'concentration', 'well', 'time', 'signal'. Optional columns include 'cpid' (compound ID) and 'vendor'. Other columns will not be used. ```py import pandas as pd from cdwave import data from cdwave import derive # Load and convert df = pd.read_csv('data.csv') loader = data.StandardCSVLoader(data=df) dataset = loader.transfer() # Calculate parameters # The calculated parameters will be included in the dataset derive.calc_parameters_for_waveforms(dataset) # Save and load dataset dataset.save('data.pickle.gz') dataset = Data.loaddata('data.pickle.gz') # Export parameters parameter_df = dataset.get_parameter_df() parameter_df.to_csv(os.path.join(data_path, 'parameters.csv')) ``` GUI has been moved to [CarioWaveGUI](https://github.com/zealseeker/CardioWaveGUI) ```sh # Run by python package python -m CardioWaveGUI # Or run by command python CardioWaveGUI/gui.py ``` ![](docs/pic/gui.png) ## Installation ### Requirements Basic requirements for core functions (deriving parameters from waveforms) ``` numpy>=1.16 scipy>=1.2 tqdm>=4.32 pandas>=0.24 statsmodels>=0.10.2 ``` For GUI support and parameter analysis ``` matplotlib>=3.1 pyqt5>=5.9 ``` All the packages required are included in the lastest Anaconda envrionment. ## Make documents 0. Matplotlib is required to render pictures 1. Generate source code of documents ``` sphinx-apidoc -o docs/source -f cdwave ``` 2. Build ``` sphinx-build docs docs/_build ```


نیازمندی

مقدار نام
- statsmodels
- tqdm
- joblib


نحوه نصب


نصب پکیج whl CardioWave-0.2.3:

    pip install CardioWave-0.2.3.whl


نصب پکیج tar.gz CardioWave-0.2.3:

    pip install CardioWave-0.2.3.tar.gz