معرفی شرکت ها

CNVpytor-1.2.1

Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
1.2.1
1.0b3
1.0b2
1.0a4
1.0b3
1.0b2

توضیحات

Python extension of CNVnator
ویژگی مقدار
سیستم عامل OS Independent
نام فایل CNVpytor-1.2.1
نام CNVpytor
نسخه کتابخانه 1.2.1
نگهدارنده []
ایمیل نگهدارنده []
نویسنده Milovan Suvakov, Abyzov Lab, Mayo Clinic
ایمیل نویسنده suvakov@gmail.com
آدرس صفحه اصلی https://github.com/abyzovlab/CNVpytor
آدرس اینترنتی https://pypi.org/project/CNVpytor/
مجوز -
![CNVpytor Logo](https://raw.githubusercontent.com/abyzovlab/CNVpytor/master/cnvpytor/imgs/cnvpytor_w_640.png) [3D printable CNVpytor logo (stl file)](https://github.com/abyzovlab/CNVpytor/blob/master/imgs/CNVpytor.stl) # CNVpytor - a python extension of CNVnator CNVpytor is a Python package and command line tool for CNV/CNA analysis from depth-of-coverage by mapped reads developed in Abyzov Lab, Mayo Clinic. Follow [CNVpytor Twitter account](https://twitter.com/cnvpytor). ### Citing CNVpytor CNVpytor: a tool for copy number variation detection and analysis from read depth and allele imbalance in whole-genome sequencing <br />Milovan Suvakov, Arijit Panda, Colin Diesh, Ian Holmes, Alexej Abyzov, GigaScience, Volume 10, Issue 11, November 2021, giab074 [https://doi.org/10.1093/gigascience/giab074](https://doi.org/10.1093/gigascience/giab074) ## Learn how to use CNVpytor in 10 minutes * [Geting started](GettingStarted.md) with command line interface * [Jupyter notebook](examples/PythonLibraryGuide.ipynb): How to use CNVpytor from Python * [Google Colab](examples/Colab.ipynb): With CEPH trio example dataset * [Video Tutorial](https://www.youtube.com/watch?v=RJMQtrD0SuE): 3-minute YT demo ## Gallery | | | |---|---| | Manhattan plot ([see example](examples/manhattan.md))| Circular plot ([see example](examples/circular.md))| |<img src="https://raw.githubusercontent.com/abyzovlab/CNVpytor/master/imgs/manhattan.png" width="512px">|<img src="https://raw.githubusercontent.com/abyzovlab/CNVpytor/master/imgs/circular.png" width="512px">| | Region plot ([see example](examples/region.md))| Compare regions ([see example](examples/compare.md))| |<img src="https://raw.githubusercontent.com/abyzovlab/CNVpytor/master/imgs/region.png" width="512px">|<img src="https://raw.githubusercontent.com/abyzovlab/CNVpytor/master/imgs/compare.png" width="512px">| | Merging and annotating calls ([see example](examples/merging.md))|Call somatic CNAs ([see example](examples/JointCaller.md))| |<img src="https://raw.githubusercontent.com/abyzovlab/CNVpytor/master/imgs/merging.png" width="512px">|<img src="https://raw.githubusercontent.com/abyzovlab/CNVpytor/master/imgs/joint_caller.png" width="512px"> ## Install ``` > pip install cnvpytor > cnvpytor -download ``` ## Using Check [CNVpytor github page](https://github.com/abyzovlab/CNVpytor). ## License Released under MIT licence.


نحوه نصب


نصب پکیج whl CNVpytor-1.2.1:

    pip install CNVpytor-1.2.1.whl


نصب پکیج tar.gz CNVpytor-1.2.1:

    pip install CNVpytor-1.2.1.tar.gz