معرفی شرکت ها

CIRIquant-1.1.2

Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
1.1.2
1.1.1
1.1
1.0.2
1.0.1
1.0
1.1.2
1.1.1
1.1
1.0.2
1.0.1
1.0

توضیحات

circular RNA quantification pipeline
ویژگی مقدار
سیستم عامل -
نام فایل CIRIquant-1.1.2
نام CIRIquant
نسخه کتابخانه 1.1.2
نگهدارنده ['Jinyang Zhang']
ایمیل نگهدارنده ['zhangjinyang@biols.ac.cn']
نویسنده Jinyang Zhang
ایمیل نویسنده zhangjinyang@biols.ac.cn
آدرس صفحه اصلی https://github.com/bioinfo-biols/CIRIquant
آدرس اینترنتی https://pypi.org/project/CIRIquant/
مجوز MIT
## CIRIquant ## [![Build Status](https://staging.travis-ci.com/bioinfo-biols/CIRIquant.svg?branch=master)](https://staging.travis-ci.com/bioinfo-biols/CIRIquant) ![GitHub release (latest by date)](https://img.shields.io/github/v/release/bioinfo-biols/CIRIquant) [![The MIT License](https://img.shields.io/badge/license-MIT-orange.svg)](https://github.com/bioinfo-biols/CIRIquant/blob/master/LICENSE) ![GitHub All Releases](https://img.shields.io/github/downloads/bioinfo-biols/CIRIquant/total) ![SourceForge](https://img.shields.io/sourceforge/dm/ciri/CIRIquant) ![Readthedoc](https://readthedocs.org/projects/ciriquant-cookbook/badge/?version=latest) CIRIquant is a comprehensive analysis pipeline for circRNA detection and quantification in RNA-Seq data ### Documentation ### Documentation is available online at [https://ciriquant-cookbook.readthedocs.io/en/latest/index.html](https://ciriquant-cookbook.readthedocs.io/en/latest/index.html) ### Author ### Authors: Jinyang Zhang(zhangjinyang@biols.ac.cn), Fangqing Zhao(zhfq@biols.ac.cn) Maintainer: Jinyang Zhang ### Release Notes ### - Version 1.1: Added support for stranded library and GFF3 format input. - Version 1.0: The first released version of CIRIquant. ### License ### The code is released under the MIT License. See the `LICENSE` file for more detail. ### Citing CIRIquant - Zhang, J., Chen, S., Yang, J. et al. Accurate quantification of circular RNAs identifies extensive circular isoform switching events. Nat Commun 11, 90 (2020) [doi:10.1038/s41467-019-13840-9](https://doi.org/10.1038/s41467-019-13840-9)


نیازمندی

مقدار نام
==1.2.1 argparse
==5.1.1 PyYAML
==0.15.2 pysam
==1.16.4 numpy
==1.2.2 scipy
==0.20.3 scikit-learn
==2.6.9 numexpr


نحوه نصب


نصب پکیج whl CIRIquant-1.1.2:

    pip install CIRIquant-1.1.2.whl


نصب پکیج tar.gz CIRIquant-1.1.2:

    pip install CIRIquant-1.1.2.tar.gz