معرفی شرکت ها

CGRtools-4.1.35

Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

توضیحات

-
ویژگی مقدار
سیستم عامل -
نام فایل CGRtools-4.1.35
نام CGRtools
نسخه کتابخانه 4.1.35
نگهدارنده []
ایمیل نگهدارنده []
نویسنده Dr. Ramil Nugmanov, Dr. Timur Madzhidov, Valentina Afonina
ایمیل نویسنده tmadzhidov@gmail.com
آدرس صفحه اصلی https://github.com/cimm-kzn/CGRtools
آدرس اینترنتی https://pypi.org/project/CGRtools/
مجوز LGPLv3
CGRTools ======== .. image:: https://zenodo.org/badge/14690494.svg :target: https://zenodo.org/badge/latestdoi/14690494 Tools for processing of reactions based on Condensed Graph of Reaction (CGR) approach. Basic operations: - Read/write/convert formats: MDL .RDF (RXN) and .SDF (MOL), .MRV, SMILES, INCHI (Linux and Windows), .XYZ, .PDB - Standardize molecules and reactions and valid structures checker. - Duplicate searching. - Tetrahedron, Allene and CIS-TRANS stereo checking. - Produce CGRs. - Perform subgraph search. - Build/edit molecules and reactions. - Produce template based reactions and molecules. - Atom-to-atom mapping checker and rule-based fixer. - Perform MCS search. - 2d coordinates generation (based on `SmilesDrawer <https://github.com/reymond-group/smilesDrawer>`_) - 2d/3d depiction. Full documentation can be found `here <https://cgrtools.readthedocs.io>`_ INSTALL ======= Highly recommended to use python 3.8+. Python 3.6 and 3.7 deprecated. Linux Debian based ------------------ * Install python3.8, virtualenv and git:: sudo apt install python3.8 python3.8-dev git python3-virtualenv * Create new environment and activate it:: virtualenv -p python3.8 venv source venv/bin/activate Mac --- * Install python3.8 and git using `brew <https://brew.sh>`_:: brew install git brew install python3 * Install virtualenv:: pip install virtualenv * Create new environment and activate it:: virtualenv -p python3.8 venv source venv/bin/activate Windows ------- * Install python3.8 and git using `Chocolatey <https://chocolatey.org/>`_:: choco install git choco install python3 * Install virtualenv:: pip install virtualenv * Create new environment and activate it:: virtualenv venv venv\Scripts\activate General part ------------ * **stable version available through PyPI**:: pip install CGRTools * Install CGRtools with MRV files parsing support:: pip install CGRTools[mrv] * Install CGRtools with structures `clean2d` support (Note: install NodeJS into system, see `details <https://github.com/sqreen/PyMiniRacer>`_):: pip install CGRtools[clean2d] * Install CGRtools with optimized XYZ parser:: pip install CGRtools[jit] **If you still have questions, please open issue within github.** PACKAGING ========= For wheel generation just type next command in source root:: python setup.py bdist_wheel COPYRIGHT ========= * 2014-2022 Timur Madzhidov tmadzhidov@gmail.com product owner, idea and development supervision * 2014-2021 Ramil Nugmanov nougmanoff@protonmail.com main developer * 2021-2022 Valentina Afonina valiaafo@yandex.ru development and support CONTRIBUTORS ============ * Dinar Batyrshin batyrshin-dinar@mail.ru * Timur Gimadiev timur.gimadiev@gmail.com * Adelia Fatykhova adelik21979@gmail.com * Tagir Akhmetshin tagirshin@gmail.com * Ravil Mukhametgaleev sonic-mc@mail.ru * Valentina Afonina valiaafo@yandex.ru CITE THIS ========= CGRtools: Python Library for Molecule, Reaction, and Condensed Graph of Reaction Processing. Journal of Chemical Information and Modeling 2019 59 (6), 2516-2521. DOI: 10.1021/acs.jcim.9b00102


نیازمندی

مقدار نام
<0.2,>=0.1.4 CachedMethods
>=0.4.0 py-mini-racer
>=1.18 numpy
>=0.50 numba
>=4.1 lxml


زبان مورد نیاز

مقدار نام
>=3.6.1 Python


نحوه نصب


نصب پکیج whl CGRtools-4.1.35:

    pip install CGRtools-4.1.35.whl


نصب پکیج tar.gz CGRtools-4.1.35:

    pip install CGRtools-4.1.35.tar.gz