معرفی شرکت ها


CAMIViz-0.1.1


Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

توضیحات

A collection of tools to visualize CAMI profiling outputs
ویژگی مقدار
سیستم عامل -
نام فایل CAMIViz-0.1.1
نام CAMIViz
نسخه کتابخانه 0.1.1
نگهدارنده []
ایمیل نگهدارنده []
نویسنده David Koslicki
ایمیل نویسنده dmk333@psu.edu
آدرس صفحه اصلی https://github.com/dkoslicki/CAMIProfilingVisualization
آدرس اینترنتی https://pypi.org/project/CAMIViz/
مجوز MIT
# CAMIProfilingVisualization A collection of tools to visualize CAMI profiling outputs # Installation Use conda ```bash conda config --add channels defaults conda config --add channels bioconda conda config --add channels conda-forge conda create -c etetoolkit -y -n CAMIViz python=3.7 numpy ete3 seaborn pandas matplotlib biom-format conda activate CAMIViz ``` # Example usage ```bash python src/profile_to_plot.py -i data/prediction_multi.profile -g data/ground_truth_multi.profile -b test -s sample_0 genus ``` This should result in a plot that visually represents the relative abundance of the taxonomic profiles produced by numerous taxonomic profiling methods. An example plot can be found [here](https://github.com/dkoslicki/CAMIProfilingVisualization/blob/master/data/test_tree_genus.png)


نیازمندی

مقدار نام
- biom-format
- ete3
- matplotlib
- numpy
- pandas
- seaborn


نحوه نصب


نصب پکیج whl CAMIViz-0.1.1:

    pip install CAMIViz-0.1.1.whl


نصب پکیج tar.gz CAMIViz-0.1.1:

    pip install CAMIViz-0.1.1.tar.gz