معرفی شرکت ها

تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

توضیحات

Internal BFSSI package for retrieving files from BaseMount

ویژگی	مقدار
سیستم عامل	-
نام فایل	BaseMountRetrieve-0.8.1
نام	BaseMountRetrieve
نسخه کتابخانه	0.8.1
نگهدارنده	[]
ایمیل نگهدارنده	[]
نویسنده	Forest Dussault
ایمیل نویسنده	forest.dussault@canada.ca
آدرس صفحه اصلی	https://github.com/bfssi-forest-dussault/BaseMountRetrieve
آدرس اینترنتی	https://pypi.org/project/BaseMountRetrieve/
مجوز	-

# BaseMountRetrieve Package for retrieving files from BaseMount in the output style of a local MiSeq run. ### Output Directory Sample ``` Project ├── 20180714_WGS_M01308 │ ├── Config │ ├── Data │ │ └── Intensities │ │ └── BaseCalls │ ├── Images │ ├── InterOp │ ├── Logs │ ├── Recipes │ └── Thumbnail_Images └── 20181102_WGS_M01308 ├── Config ├── Data │ └── Intensities │ └── BaseCalls ├── Images ├── InterOp ├── Logs ├── Recipes └── Thumbnail_Images ``` ### Requirements - [BaseMount](https://basemount.basespace.illumina.com/) (Confirmed supported version: Illumina BaseMount v0.15.96.2154) - Python 3.6 ### Installation `pip install basemountretrieve` ### Usage ``` Usage: basemountretrieve [OPTIONS] BaseMountRetrieve will tap into the mounted BaseMount filesystem and retrieve an entire Project (or single Run) in the output style of a local MiSeq run. Options: -p, --project-dir PATH Path to the directory on BaseMount for a particular project. e.g. basemount/Projects/[your project]. -e, --experiment-name TEXT Searches BaseMount for the name of a run/experiment and attempts to retrieve its contents. Must be used along with the --basemount-dir parameter. Cannot be used alongside the --project-dir flag. -b, --basemount-dir PATH Path to root directory for BaseMount, e.g. ~/basemount/. Must be supplied alongside --experiment-name parameter. -o, --out-dir PATH Directory to dump all runs for project. [required] -r, --rename Use this flag to automatically re-name the R1 and R2 files to just include the Sample ID. -v, --verbose Use this flag to enable more verbose output. --version Use this flag to print the version and exit. --help Show this message and exit. ```

نحوه نصب

نصب پکیج whl BaseMountRetrieve-0.8.1:

pip install BaseMountRetrieve-0.8.1.whl

نصب پکیج tar.gz BaseMountRetrieve-0.8.1:

pip install BaseMountRetrieve-0.8.1.tar.gz