معرفی شرکت ها

تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

توضیحات

Burrows Wheeler Transform (BWT) search

ویژگی	مقدار
سیستم عامل	-
نام فایل	BWTsearch-0.1.15
نام	BWTsearch
نسخه کتابخانه	0.1.15
نگهدارنده	[]
ایمیل نگهدارنده	[]
نویسنده	-
ایمیل نویسنده	-
آدرس صفحه اصلی	-
آدرس اینترنتی	https://pypi.org/project/BWTsearch/
مجوز	MIT

**Burrows Wheeler Transform (BWT) search** Import the `BWT` class into your namespace for convenience: ``` from BWTsearch import BWT ``` Initialize a BWT of text with instantiating the BWT class: ``` text = "AGATA" ``` ``` bwt = BWT(text) ``` The instance bwt now will contain all necessary indices for efficiently searching: - `bwt.bwt` ... contains the BWT string - `bwt.position_list` ... contains the start positions of the rotations for each character of bwt - `bwt.ranks` ... contains rank indices for each character of the alphabet in bwt - `bwt.cnums` ... contains number of character occurances of the alphabet in bwt Use the `search()` function to obtain a list of positions of exact matches for pattern in text: ``` pattern = "AT" ``` ``` bwt.search(pattern) ``` This returns a list with indexes into text where an exact match occurs. Empty list if none. The pattern will be searched case-sensitive and should not contain $. Use the `get_text()` function to retrieve the original text from the BWT instance: ``` bwt.get_text() ``` If a sequence file is available, a genome can be loaded from a FASTA file: ``` phix = BWT.from_fast_file("phix.fa") ``` ``` phix.search("AGATA") ```

نحوه نصب

نصب پکیج whl BWTsearch-0.1.15:

pip install BWTsearch-0.1.15.whl

نصب پکیج tar.gz BWTsearch-0.1.15:

pip install BWTsearch-0.1.15.tar.gz