معرفی شرکت ها

تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

توضیحات

Python package for inference of the gene regulatory network and the boolean network using RNA-Seq data.

ویژگی	مقدار
سیستم عامل	-
نام فایل	Augusta-1.0.3
نام	Augusta
نسخه کتابخانه	1.0.3
نگهدارنده	[]
ایمیل نگهدارنده	[]
نویسنده	Jana Musilova, Zdenek Vafek, Karel Sedlar
ایمیل نویسنده	musilovajana@vut.cz
آدرس صفحه اصلی	https://github.com/JanaMus/Augusta
آدرس اینترنتی	https://pypi.org/project/Augusta/
مجوز	MIT

Augusta ========== Python package: From RNA-Seq to the Boolean Network through the Gene Regulatory Network Documentation and tutorials are available at `augusta.readthedocs.io <https://augusta.readthedocs.io>`_. Quick Guide ---------------- Dependencies: - Python 3, versions 3.7 and 3.8 - Docker **Installation:** We highly recomment installing and using Augusta in a virtual environment. .. code-block:: $ conda create -n Augusta_venv python=3.7 anaconda $ conda activate Augusta_venv .. code-block:: $ pip install Augusta **Usage:** See `Inputs <https://augusta.readthedocs.io/en/latest/User%20guide.html>`_ for details about input files and variables. .. code-block:: $ python >>> import Augusta GRN and BN inference using RNA-Seq: .. code-block:: >>> Augusta.RNASeq_to_SBML(count_table_input = 'MyCT_file.csv', promoter_length = My_number, genbank_file_input = 'MyGB_file.gb', normalization_type = 'My_string') GRN inference using RNA-Seq: .. code-block:: >>> GRN = Augusta.RNASeq_to_GRN(count_table_input = 'MyCT_file.csv', promoter_length = My_number, genbank_file_input = 'MyGB_file.gb', normalization_type = 'My_string') BN inference using GRN: .. code-block:: >>> Augusta.GRNtoBN(GRN_input = 'MyGRN_file.csv', promoter_length = My_number, genbank_file_input = 'MyGB_file.gb', add_dbs_info = 'My_string')

زبان مورد نیاز

مقدار	نام
>=3.7, <3.9	Python

نحوه نصب

نصب پکیج whl Augusta-1.0.3:

pip install Augusta-1.0.3.whl

نصب پکیج tar.gz Augusta-1.0.3:

pip install Augusta-1.0.3.tar.gz